El objetivo de la convocatoria es financiar proyectos de investigación que cumplan con el fin para el cual fue creado el Fondo del Sistema. Busca impulsar acciones y tareas de construcción y desarrollo del Sistema de Educación Superior Universitaria Estatal. 
Los proyectos deberán enmarcarse en el contexto del Plan Nacional de la Educación Superior vigente al momento de la formulación y responder a los objetivos y las acciones estratégicas, consideradas en el mismo.
Las personas participantes en los proyectos deberán cumplir con estos lineamientos, así como con los establecidos por la Comisión de Vicerrectores de Investigación.